HYPP bij de quarters (hyperkalemic-periodic-paralysis)
SCID bij arabieren (severe-combined-immunodeficiency)
Overo lethal white foal syndrome (niet echt erfelijk in de klassieke zin, maar een kruising van 2 paarden met een bepaalde kleur geeft kans op een volledig wit veulen met bepaalde gebreken)
Cornage (is omstreden, heeft waarschijnlijk meer met de grootte van het paard te maken dan pure erfelijkheid)
Ongelijke voorvoetjes (o.a. veel Concorde's hebben dit, ze zijn overigens vaak 100% op de benen, super paardjes)
Zomereczeem (in ieder geval bij de Fries en de fjorden)
Waarschijnlijk ook dwerggroei bij Friezen
OC(D) (ook omstreden, sommigen zeggen dat het meer met voeding/beweging/grootte te maken heeft)
Stalgebreken (er zijn lijnen waar veel luchtzuigers uit voortkomen)
De vos-factor bij Friezen, niet echt een gebrek, maar wel ongewenst
Franse stand, toontreden, steil achterbeen, reebeen zijn ook allemaal deels erfelijk.
Bij haflingers is de aanleg voor het ontwikkelen van een bepaalde vorm van huidkanker op/bij het oog ook erfelijk (komt althans met name voor bij de Nederlands haflingers, en nauwelijks bij de lijnen uit andere landen). Het gaat dan om 'plaveiselcelcarcinoom'.
Nou, meer weet ik er effe niet, kom ik ergens op dan hoor je het nog wel.