

Basiskleur
Basiskleur van een haflinger is zoals algemeen bekend, vos. Dat zijn ze altijd. De genen die vos veroorzaken zijn recessief, dus een voskleurig paard heeft altijd 2 ouders die het vosgen ook dragen, deze hoeven niet persé voskleurig te zijn. Zwart wordt aangeduid met E en vos wordt aangeduid met e. Dat maakt haflingers ee en homozygoot. Ze kunnen dus alleen e aan hun nakomelingen doorgeven en zullen dat ook altijd doen.
Genmutaties
Flaxen
Flaxen is een eigenschap die alleen voorkomt bij paarden met de basiskleur vos, het veroorzaakt de kleur zweetvos. Zweetvossen zijn paarden met de basiskleur vos die witte manen en staart hebben. Ook het behang boven de hoeven kleurt wit.
Onderzoekers zijn er achter gekomen dat het gen enkel invloed heeft op de langere haren van het paard. Het gen zorgt ervoor dat het rode pigment niet te zien is en de haren dus wit worden.
Flaxen is een recessief gen,daarom wordt het flaxen-gen vaak aangegeven met de lettercode f. Dit gen komt enkel bij paarden met de basiskleur vos (dus ook palomino etc.) tot uiting. (Paarden met de basiskleuren bruin en zwart kunnen het f-gen wel dragen, maar dit is dan niet te zien in het uiterlijk.)
Panagaré/Mealy
Panagaré veroorzaakt meelkleurige haren op bepaalde lichaamsdelen. Onder andere op de buik, de zogenaamde zachte delen (flanken, tussen voorbenen e.d.), op het uiteinde van de neus en rond de ogen. Panagaré wordt aangeduid met Pa+.
Moeten alle kenmerken van mealy aanwezig zijn? Want alle haflingers hebben een lichte neus en lichte haren rond de ogen. Er zijn echter wel die ook witte zachte delen hebben, maar lang niet allemaal, zeker niet in zomervacht.
Agouti
Wat agouti (A) betreft, zijn haflingers een verhaal apart. Bijna alle haflingers zijn namelijk homozygoot voor agouti. Niet allemaal dus, maar het grootste deel wel.
De meeste haflingers zullen dus qua genotype eeAA zijn, maar ook eeAa en eeaa kunnen voorkomen.
Sooty
Dit gen maakt de onder vacht kleur donkerder door er een deken over te leggen: vos wordt bijv. koffievos. Het heeft de neiging heeft om de kleur 'vies' te maken. Bij deze kleurfactor mengen zich zwarte haren door de vacht, hierdoor worden de paarden donkerder.
Sommige vossen kunnen door Sooty zo donker worden dat het moeilijk vast te stellen is welke kleur ze nu daadwerkelijk hebben, omdat door het Sooty gen de manen en staart ook veel zwarte haren kunnen hebben. Paarden met het Sooty gen kunnen naarmate ze ouder worden ook steeds donkerder van kleur worden. Sooty komt voor bij alle denkbare kleuren. Bij haflingers is dit de veroorzaker van grijs behang. Sooty wordt geacht recessief dominant te zijn. De code is Sti.
Het is bekend dat de meeste haflingers sooty hebben, echter naar het schijnt, niet allemaal. Is dit een vermoeden of is dit bewezen?
Roan en schimmel
Roan en schimmel komen bij haflingers niet voor.
Schimmel is een dominant gen en wordt aangeduid met G. Een paard kan zowel homozygoot als hetrozygoot zijn voor G. Met een hetrozygote schimmel heb je dus 50% kans op een schimmel nakomeling, met een homozygote schimmel heb je altijd een schimmelveulen.
Roan is hetrozygoot dominant, Rn. Homozygoot dominant kan ook, maar is niet levensvatbaar. Homozygoot dominant kan niet bij een haflingerkruising.
Verdunningskleuren
Een haflinger heeft nooit verdunningskleuren, een nakomeling van een haflinger kan dit wel hebben, maar alleen door de vader.
Creme
Het creme-gen is incompleet dominant, dat betekent dat het effect bij een heterozygoot wel zichtbaar is, maar niet zo sterk als bij een homozygoot. Een haflingerkruising zal altijd heterozygoot zijn. Bij een dekking met een cremehengst, kun je afhankelijk van de basiskleur van de vader, en het wel of niet aanwezig zijn van agouti, een palomino, valk of smokeyblack veulen krijgen in 50% van de gevallen. Dek je met een cremello, perlino of smokey cream, dan krijg je zeker weten een palomino, valk of smokeyblack. Dubbele verdunning is nooit mogelijk bij een haflingernakomeling. nCr is de code waarmee creme wordt weergegeven.
Dun
Dun is een verdunningsgen dat zowel rode als witte haren verbleekt. Daarnaast zorgt het voor primitieve aftekeningen. Dun wordt aangegeven met DN+. Omdat dun een dominant gen is, hebben alle dunpaarden tenminsten 1 dun ouder. Een paard kan zowel homozygoot als hetrozygoot zijn voor DN+. Met een hetrozygote dun heb je dus 50% kans op een dun nakomeling, met een homozygote heb je altijd een dun veulen.
Silver
De verdunningskleur silver, ofwel zilverappel, heeft alleen invloed op zwart pigment. Vossen kunnen dus drager zijn van het Silver-gen zonder dat dit zichtbaar is. Bij bruine paarden heeft Silver weinig effect op de vachtkleur omdat zich daar geen zwart pigment bevindt.
Qua vererving geldt hetzelfde als voor dun. nZ of ZZ is Silver.
Champagne
Champagne is een verdunningskleur die zowel de zwarte als rode haren verdunt. Omdat het Champagne-gen dominant is is er maar 1 ouder nodig om een Champagne veulen te krijgen. Ch is de aanduiding voor Champagne.
Pearl
Uit een haflinger een pearl fokken is onmogelijk. Pearl komt bij haflingers niet voor, en voor een pearl veulen, moeten de ouders beide pearl zijn.
Sabino
Sabino is een witpatroon dat op alle kleuren paarden kan voorkomen. Tot nu toe is er nog maar één vorm van Sabino genetisch aanwijsbaar, het Sabino1-gen (SB1). Dit is een incompleet dominant gen: een heterozygoot paard zal gedeeltelijk witte aftekeningen hebben, en paarden die homozygoot zijn voor het aantoonbare Sabino1-gen worden voor minimaal 90% wit geboren.
Haflingers hebben dit SB1 gen, maar zijn er heterozygoot voor. Sabinopatronen die voorkomen bij haflingers zijn:
Roaned Sabino (Stekelharig)
Vooral roaning langs de aftekeningen maar ook verspreid over het gehele lichaam. De hoeveelheid witte haren kan in de loop van de jaren toenemen.
Minimum Sabino
Een veelvoorkomende en vaak onopgemerkte vorm van Sabino. Het kan variëren van een enkele bles, of witte benen tot duidelijke onregelmatige randen van aftekeningen met roaning of enkel een vreemde witte vlek of een blauw oog. Ook minimale roaning op het lichaam is vaak een kenmerk.
Kleurmutaties die voorkomen bij haflingers
Birdcatcher Spots
Bend or spots
Birdcatcher ticking
Conclusie:
Haflinger:
Basiskleur: ee
Flaxen: ff
Agouti: aa, Aa of AA
Mealy: Pa+
Sooty: Sti
Sabino: SbSb