Bokt.nl

**Geplaatst door de TopicStarter** : 20-12-12 14:50

Genetische invloed van OC(D) nader onderzocht

Geplaatst door de TopicStarter : 20-12-12 14:50

* http://www.bokt.nl

In een gewricht bij het opgroeiende paard zit er eerst kraakbeen op de uiteinden van de botten. Dit kraakbeen wordt op een gegeven moment omgezet naar bot. De omvorming van kraakbeen naar bot kan echter verstoord raken. Het kraakbeen wordt dan niet vervangen door bot, maar de kraakbeenlaag wordt steeds dikker. Het kraakbeen krijgt normaal zijn voedingsstoffen vanuit de gewrichtsvloeistof (synovia) door middel van diffusie. Wanneer het kraakbeen te dik wordt, kan dit niet meer. De kwaliteit van het kraakbeen zal daardoor verslechteren en er kunnen scheurtjes ontstaan. Het stadium van verdikking van het kraakbeen en scheurtjes wordt osteochondrose (OC) genoemd. Wanneer er door de scheurtjes stukjes kraakbeen gaan loslaten is het stadium van de osteochondrose dissecans (OCD) bereikt. OC en OCD komen met name voor bij jonge paarden die nog niet of nog maar kort aan het werk zijn. Grote en snelgroeiende paarden ontwikkelen vaker OC of OCD. Vooral in het kniegewricht of spronggewricht kan OC(D) ontstaan, maar ook andere gewrichten kunnen aangetast zijn. In sommige gevallen kan OC(D) bij jonge paarden door de groei weer verdwijnen. Wanneer er op een röntgenfoto OC(D) wordt gediagnosticeerd, hoeft dit niet altijd voor klinische problemen te zorgen. Sommige paarden zullen er nooit kreupel van gaan lopen, maar soms ook wel.

Engelse onderzoekers hebben onderzoek gedaan naar de genetische invloed op OC(D). Naast diverse omgevingsfactoren zoals groei, voedingsstoffen, lichaamsbouw en hormonen speelt erfelijkheid ook een bepaalde rol bij de ontwikkeling van OCD bij paarden. Onderzoekers van de universiteit van Edinburgh, Schotland hebben bloed onderzocht van 169 (90 hengsten, 79 merries) volbloedpaarden die gediagnosticeerd zijn met OCD. Dit hebben zij vergeleken met bloed van 179 (69 hengsten, 110 merries) volbloedpaarden die geen OCD hebben. In de jaren 2007 en 2008 is er bloed getrokken van dus in totaal 348 volbloedpaarden (159 hengsten, 189 merries). De paarden waren tussen de 9 en 12 maanden oud en kwamen van 19 verschillende stallen uit de omgeving van de universiteit. Van elke stal kwam ongeveer evenveel aangetaste als OCD vrije paarden. Grove schattingen tonen aan dat ongeveer 25 procent van de volbloedpaarden OC(D) hebben. Hierdoor valt een groot percentage paarden uit, omdat zij last hebben van de OC(D).

In 2007 is het gehele DNA van ‘het’ paard onderzocht, dit onderzoek leidde tot nadere bestudering van genetische onderzoek naar OCD. Door middel van het bloedonderzoek is er van elk paard een genetisch profiel opgemaakt. De onderzoekers hebben specifiek gekeken naar snips. Een snip is een samenvoeging van SNP, dat op haar beurt een afkorting is van single-nucleotide polymorphisms. In het Nederlands Enkel-nucleotide polymorfie. Een snip zorgt onder meer voor genetisch variatie binnen het DNA. De paardenpopulatie herbergt op dit moment meer dan 1,5 miljoen snips.

Onderzoekers hebben 40.000 snips getest en daaruit kwam naar voren dat één snip op chromosoom 3 significant geassocieerd wordt met de aanwezigheid van OCD. Volgens de onderzoekers is het onwaarschijnlijk dat deze snip zelf bijdraagt aan de ziekte, maar het zou wel een marker kunnen zijn voor een nabij gelegen gen dat wel invloed heeft op de ontwikkeling van OCD. Als onderzoekers dat gen kunnen vinden kan het bestaan en het ontwikkelen van OC(D) beter begrepen worden en de ontwikkeling binnen de populatie kan dan worden gestagneerd.

De onderzoekers willen hun uitkomst nog controleren met andere, hopelijk minder verwante en daardoor een meer onafhankelijke groep paarden, waarbij ze hopen dat chromosoom 3 nader bekeken kan worden zodat het verantwoordelijke gen gevonden kan worden.

Het onderzoek “A genome-wide association study of osteochondritis dissecans in the Thoroughbred” is gepubliceerd in het blad Mammalian Genome.

Een Engelstalige samenvatting lees je hier
Het hele artikel lees je hier (Engelstalig)
Een soortgelijk onderzoek uit Noorwegen (Engelstalig)

Zie ook:
[VN] Paard ligt genetisch verrassend dicht bij mens
[VN] Inzicht in bouwpakket "Paard" met het Horse Genome Project

Deel op Facebook Tweet Foutje gespot? Tip de redactie

**Geplaatst**: 20-12-12 16:09

Geplaatst: 20-12-12 16:09

Interessant! Hopelijk in de toekomst meer informatie over dat chromosoom!

**Geplaatst**: 20-12-12 17:28

Re: Genetische invloed van OC(D) nader onderzocht

Geplaatst: 20-12-12 17:28

De volledige genoomsequentie van het paard is toch gekend dacht ik, dus moeten ze toch weten welke genen in de buurt van de SNIP liggen en zo het juiste gen kunnen vinden.

**Geplaatst**: 20-12-12 17:31

Re: Genetische invloed van OC(D) nader onderzocht

Geplaatst: 20-12-12 17:31

http://genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgTracks ... 7&pix=1329

voila... volledige paardengenoom.

**Geplaatst**: 20-12-12 17:55

Geplaatst: 20-12-12 17:55

Huh, dat snap in niet hoor, gnoompjes

Hoor het wel als ze het in begrijpelijke taal kunnen uitleggen

**Geplaatst**: 21-12-12 08:35

Re: Genetische invloed van OC(D) nader onderzocht

Geplaatst: 21-12-12 08:35

heel interessant!

**Geplaatst**: 21-12-12 16:02

Geplaatst: 21-12-12 16:02

Men veearts vertelde me ook dat ze hiernaar onderzoek doen om in de toekomst paarden uit te sluiten die aan OCD geopereerd zijn als ze een verband kunnen legen met de genetica zoals hengsten op een hengstenkeuring.

Hoop dat het zal helpen!

**Geplaatst**: 21-12-12 17:31

Geplaatst: 21-12-12 17:31

ff reageren om deze te kunnen volgen

**Geplaatst**: 22-12-12 17:28

Re: Genetische invloed van OC(D) nader onderzocht

Geplaatst: 22-12-12 17:28

Interessant - ga het artikel eens lezen!

(ben bekend met soortgelijk onderzoek, maar dan in de context van hersenziekten).

**Geplaatst**: 22-12-12 17:51

Geplaatst: 22-12-12 17:51

s0173957 schreef:
De volledige genoomsequentie van het paard is toch gekend dacht ik, dus moeten ze toch weten welke genen in de buurt van de SNIP liggen en zo het juiste gen kunnen vinden.

Dat is ook zo, maar met een complex disorder zoals OCD verwacht je meerdere genen die een bijdrage leveren in de genetische variatie binnen de ziekte en bovendien zeggen ze over het gen dat nabij ligt:
"Whilst the likely function of KLF3 does not preclude its relevance, there is no evidence of a direct role for this gene in OC."

Ik mis alleen nog een joint analysis van SNPs waarbij de correlatie van alle SNPs met de causale wordt uitgezet tegen de absolute Z-score van de P-waardes. Dan kun je zien of de omliggende SNPs zich ook gedragen alsof die ene inderdaad causaal is. Toegegeven, in dit geval kan de LD in het gebied te laag zijn, maar het was een mooie aanvullende analyse geweest.

Een grotere N zou ook nog leuk zijn, want tegenwoordig worden bij mensen GWAS uitgevoerd met veel grotere groepen. Waarschijnlijk lastig om zoveel paardenmateriaal te verzamelen. Of een meta-analyse met verschillende cohorten met dezelfde inclusie-criteria.

**Geplaatst**: 22-12-12 19:07

Re: Genetische invloed van OC(D) nader onderzocht

Geplaatst: 22-12-12 19:07

Hier moet ik zelfs ff bij in m'n haren krabben scientifica

Ben dan ook nog net iets meer weg met kwantitatieve dan kwalitatieve genetica (vanuit m'n thesis).

Maar zo zou ik het ook vreemd vinden dat een multicausale aandoening als osteochondrose terug te brengen zou zijn op 1 gen en dat ze dus maar 1 merker gevonden hebben.

Met GWAS bedoel je toch Genome Wide Association Studies è?

**Geplaatst**: 22-12-12 19:50

Geplaatst: 22-12-12 19:50

s0173957 schreef:
Ben dan ook nog net iets meer weg met kwantitatieve dan kwalitatieve genetica (vanuit m'n thesis).

Wat gaaf!

s0173957 schreef:
Maar zo zou ik het ook vreemd vinden dat een multicausale aandoening als osteochondrose terug te brengen zou zijn op 1 gen en dat ze dus maar 1 merker gevonden hebben.

Met GWAS bedoel je toch Genome Wide Association Studies è?

Ja dat bedoel ik met GWAS. Het komt meer voor dat complexe ziektes maar 1 piek geven en dan zelfs nog amper significant. Je verwacht ook een klein signaal als het een common variant is, anders zou deze al weggeselecteerd zijn uit je populatie. Maar zelf denk ik dat we naar rare variants en eventueel zelfs de novo mutaties binnen het individu moeten kijken. Zowel Han Brunner als Naomi Wray hebben daar in Nat Rev Genetics een aantal aardige artikelen over.

**Geplaatst**: 22-12-12 22:37

Re: Genetische invloed van OC(D) nader onderzocht

Geplaatst: 22-12-12 22:37

Een marker vinden in een GWAS is knap lastig, helemaal als je maar 169 paarden hebt.

**Geplaatst**: 23-12-12 11:31

Re: Genetische invloed van OC(D) nader onderzocht

Geplaatst: 23-12-12 11:31

Terwijl er zo veel paarden elk jaar gekeurd worden... een buisje bloed mee aftappen en je hebt er direct een pak meer, bij de mijne mogen ze het allemaal doen als die gekeurd worden...

**Geplaatst**: 23-12-12 20:54

Geplaatst: 23-12-12 20:54

Hm, een wat verwarrende inleiding van het artikel. Ik heb de indruk dat kraakbeen van de groeischijven met het kraakbeen van gewrichtsopppervlakken verward wordt.

Nomineer dit bericht ×